分子蒸馏时一种特别的液-液别离技能，在真空状态下，使蒸气分子的平均自在程大于蒸腾外表与冷凝外表之间的间隔，然后可利用料液中各组分蒸腾速率的差异，对液体混合物进行别离。
惯例的蒸馏技能一般都是在沸点温度下进行的，可是分子蒸馏的时分就没有这样的条件。只需冷热两个面之间到达满意的温度差就可以了。现实也证明了这一点，因为分子蒸馏的操作温度要远远低于物料的沸点。
并且惯例蒸馏一不留神的话就有可能会呈现鼓泡、欢腾等不良现象，这当然不会在分子蒸馏进程中呈现。因为它是液膜外表的自在蒸腾，操作压力一般都比较低，受热时刻也比较短。总的来说。惯例的蒸馏的蒸腾和冷凝是可逆进程，液相和气相之间处处于动态相平衡，而分子蒸馏进程中，分子从加热面逸出的分子直接飞射到冷凝面上，所以对他来说没有约束
薄膜蒸腾器和短程分子蒸馏仪虽然都是化工出产设备，相同都是别离设备，可是薄膜正反器和短程分子蒸馏仪之间还真的有很大的差异。关于这一点，制药从两种设备的结构、功能等便利比较一下就知道了。
从结构上看两者差异的体现便是薄膜蒸腾器的气相出口在蒸腾器的顶部，以满意为轻组分的蒸汽自下向上活动的规则，而短程分子蒸馏仪正好相反，它的气相出口在蒸腾器的底部，还在于这设备中的轻组分要充沛的在内置冷凝器上进行冷凝。
其次便是设备的功能了。这方面的不同液正式因为结构上的不同所形成的。比方薄膜蒸腾器的最低操作压力可到达1mbar，而短程分子蒸馏仪则更低。可以到达0.001mbar的操作压力，可是分子蒸馏仪液有必定的约束存在，因为有内置冷凝器，因而刮膜转子没有很好的办法加底部轴承，在运转进程中会发生较大的振荡，从而影响刮膜的作用。
